Le vescicole extracellulari (EV) sono particelle di dimensioni nanometriche secrete dalla maggior parte delle cellule. EVs portare acidi nucleici che tengono promessa come potenziali biomarcatori in varie malattie.

Il virus dell'immunodeficienza umana di tipo 1 (HIV) infetta le cellule T CD4+ e induce disfunzioni immunitarie, infiammazione e secrezione di EV, ma si sa poco sul carico di RNA di piccole dimensioni EV in relazione alla disregolazione immunitaria nei soggetti affetti da HIV. Qui, caratterizziamo il piccolo RNA trasportato da EV in circolazione nei soggetti sieropositivi in terapia antiretrovirale (ART) rispetto ai controlli non infetti da sequenziamento dell'RNA di prossima generazione.

Risultati

Plasma EVs isolati da soggetti HIV-positivi e HIV-negativi nel test (n = 24) e la convalida (n = 16) coorti sono stati caratterizzati da microscopia elettronica, analisi di tracciamento delle nanoparticelle, e immunoblotting per marcatori esosomiali. Gli EV erano più abbondanti nel plasma di soggetti sieropositivi rispetto ai soggetti sieronegativi. Piccolo sequenziamento RNA di EV plasmatici nella coorte di test identificato diverse specie di RNA di piccole dimensioni tra cui miRNA, piRNA, snRNA, snoRNA, tRNA, e rRNA, con miRNA è il più abbondante. Un totale di 351 miRNA diversi sono stati rilevati in plasma EVs, con i primi 50 miRNA che rappresentano il 90% di tutti i miRNA letti. miR-26a-5p è stato il miRNA più abbondante, seguito da miR-21-5p e miR-148-3p. L'analisi qRT-PCR ha mostrato che sei miRNA (miR-10a-5p, - 21-5p, -27b-3p, - 122-5p, -146a-5p, - 423-5p) sono stati significativamente aumentati nei plasma EVs da HIV-positivi rispetto ai soggetti HIV-negativi nella coorte di convalida. Inoltre, miR-21-5p, -27b-3p, -146a-5p, -146a-5p, e - 423-5p correlato positivamente con i marcatori metabolici dello stress ossidativo e negativamente con gli acidi grassi polinsaturi anti-infiammatori. Sovrappresentazione e analisi di arricchimento della via di arricchimento dei miRNA e dei loro geni bersaglio previsto associazione funzionale con le risposte di stress ossidativo, segnalazione di interferone gamma, segnalazione del recettore Toll-like, TGF segnalazione beta, e segnalazione Notch.

Conclusioni

Gli individui positivi all'HIV su ART hanno aumentato l'abbondanza di veicoli elettrici circolanti che trasportano diversi piccoli RNA, con i miRNA che sono i più abbondanti. Diversi miRNA associati all'infiammazione e allo stress ossidativo sono aumentati nei veicoli elettrici circolanti di individui sieropositivi, che rappresentano potenziali biomarcatori di percorsi targetable che contribuiscono alla patogenesi della malattia.

leggi lo studio completo