Extracellulaire blaasjes (EV's) zijn deeltjes van nanogrootte die door de meeste cellen worden afgescheiden. EV's bevatten nucleïnezuren die veelbelovend zijn als potentiële biomarkers voor verschillende ziekten.

Menselijke immunodeficiëntie virus type 1 (HIV) infecteert CD4+ T cellen en induceert immuundysfunctie, ontsteking en EV afscheiding, maar er is weinig bekend over EV kleine RNA lading in relatie tot immuundysregulatie bij HIV-geïnfecteerde personen. Hier karakteriseren we kleine RNA gedragen door circulerende EV's in HIV-positieve personen op antiretrovirale therapie (ART) ten opzichte van niet-geïnfecteerde controles door volgende generatie RNA sequencing.

Resultaten

Plasma EV's geïsoleerd van hiv-positieve en hiv-negatieve proefpersonen in test (n = 24) en validatie (n = 16) cohorten werden gekarakteriseerd door elektronenmicroscopie, nanopartikel tracking analyse, en immunoblotting voor exosoommarkers. EV's waren overvloediger in plasma van HIV-positieve proefpersonen in vergelijking met HIV-negatieve proefpersonen. Kleine RNA sequencing van plasma EV's in de testcohort identificeerde diverse kleine RNA-soorten waaronder miRNA, piRNA, snRNA, snoRNA, tRNA, en rRNA, waarbij miRNA het meest overvloedig is. In totaal werden 351 verschillende miRNA's gedetecteerd in plasma-EV's, waarbij de top 50 miRNA's goed waren voor 90% van alle miRNA's. miR-26a-5p was de meest voorkomende miRNA, gevolgd door miR-21-5p en miR-148-3p. qRT-PCR-analyse toonde aan dat zes miRNA's (miR-10a-5p, - 21-5p, -27b-3p, - 122-5p, -146a-5p, - 423-5p) significant verhoogd waren in plasma-EV's van HIV-positieve personen in het validatiecohort in vergelijking met HIV-negatieve personen. Bovendien correleerde miR-21-5p, -27b-3p, -146a-5p, en - 423-5p positief met metaboliet merkers van oxidatieve stress en negatief met anti-inflammatoire meervoudig onverzadigde vetzuren. Over-representatie en pathway verrijking analyses van miRNAs en hun doelwit genen voorspelde functionele associatie met oxidatieve stress reacties, interferon gamma signalering, Toll-like receptor signalering, TGF beta signalering, en Notch signalering.

Conclusies

HIV-positieve personen op ART hebben een verhoogde overvloed aan circulerende EV's met diverse kleine RNA's, met miRNA's als de meest overvloedige. Verschillende miRNAs geassocieerd met ontsteking en oxidatieve stress zijn toegenomen in circulerende EV's van HIV-positieve personen, die potentiële biomarkers van targetable pathways vertegenwoordigen die bijdragen aan ziekte pathogenese.

lees de volledige studie

Connexion