Résultats

Nous avons effectué un séquençage approfondi de 42 patients atteints du carcinome hépatocellulaire avec une combinaison de génomes entiers, d’exomes et de transcriptomes séquencés pour identifier le l’environnement mutationnel du carcinome hépatocellulaire en utilisant une assez grande cohorte de découverte. Nous avons trouvé des mutations fréquentes sur TP53, CTNNB1 et AXIN1, et des mutations rares, mais probablement fonctionnelles sur BAP1 et IDH1. Outre les fréquentes intégrations du virus de l'hépatite B à TERT, nous identifions des translocations aux limites de TERT. Une nouvelle délétion a été identifiée sur CTNNB1 dans une région qui est fortement mutée dans plusieurs cancers. On trouve aussi des mutations multiples à haute fréquence alléliques dans le LAMA2 extracellulaire de la protéine de la matrice. Les niveaux inférieurs d'expression de LAMA2 entrent en corrélation avec une signature proliférative, et la prédiction d’une faible survie et plus de chances de récidive du cancer chez les patients atteints du carcinome hépatocellulaire, ce qui suggère un rôle important de la matrice extracellulaire et de l'adhésion cellulaire dans la progression tumorale d'un sous-groupe de patients atteints par le carcinome hépatocellulaire.